TortoiseMerge 不仅显示文件之间的差异，还允许您解决冲突或应用更改。

如果您处于双窗格视图，则只能编辑右侧窗格中的文件（我的）。要应用左侧文件（他们的）中所做的更改，请右键单击更改的行并选择上下文菜单 → 使用来自“他们的”的文本块。然后，左侧文件的更改将添加到右侧文件。

有时您实际上需要两个文本块，上下文菜单还提供上下文菜单 → 使用两个文本块（此块在前）和上下文菜单 → 使用两个文本块（此块在后）。

您也可以像在文本编辑器中一样编辑输出文件。此类行使用铅笔图标标记。请注意，如果您想进行上述任何基于行/块的更改，最好先进行这些更改，因为一旦您开始自己编辑文件，TortoiseMerge 就无法跟踪与原始文件的关联关系。

如果您处于三窗格视图（有时称为合并视图），则只能编辑底部视图中的文件（合并）。与双窗格视图一样，您可以右键单击冲突行，然后选择上下文菜单 → 使用来自“他们的”的文本块或上下文菜单 → 使用来自“我的”的文本块。此外，如果您想要两个块，您可以选择上下文菜单 → 在“他们的”之前使用来自“我的”的文本块或上下文菜单 → 在“我的”之前使用来自“他们的”的文本块。根据您选择的命令，更改将应用于生成的合并文件中。

有时，文件将在 Subversion 中被标记为冲突，但当您使用 TortoiseMerge 查看它时，没有显示冲突。这可能是由于您选择的空白处理方式。如果您选择忽略行尾或空白更改，这些行将使用冲突忽略图标标记。要解决冲突，您仍然需要选择要使用的版本。